Chính phủ yêu cầu Đại học Kinh tế Quốc dân tổ chức lại cơ cấu và hoạt động theo Luật Giáo dục đại học và các quy định liên quan. Trong quá trình đó, trường phải bảo đảm quyền, lợi ích của các bên, hoạt động bình thường, không để xảy ra tiêu cực, thất thoát, lãng phí tài chính, tài sản. Hội đồng trường, Hiệu trưởng tiếp tục thực hiện nhiệm vụ tới khi Bộ Giáo dục và Đào tạo công nhận hội đồng đại học và giám đốc Đại học Kinh tế Quốc dân.
Hội đồng trường, Chủ tịch Hội đồng trường, Hiệu trưởng tiếp tục thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn theo quy định hiện hành cho tới khi Bộ GD&ĐT quyết định thành lập Hội đồng Đại học, công nhận Chủ tịch Hội đồng Đại học và Giám đốc Đại học Kinh tế quốc dân theo quy định của pháp luật.
Theo dự thảo Luật quy định rõ hệ thống GDĐH Việt Nam bao gồm: Trường đại học, học viện (gọi chung là trường đại học); đại học (là tổ hợp các trường đại học; trường trực thuộc) và các cơ sở GDĐH khác phù hợp với quy định của pháp luật.
Cụ thể, "trường đại học" là cơ sở giáo dục đại học đào tạo, nghiên cứu nhiều ngành, được cơ cấu tổ chức theo Luật Giáo dục đại học 2012 sửa đổi 2018.
Còn "đại học" là tập hợp nhiều cơ sở giáo dục đại học đào tạo. Do đó, đại học có thể bao gồm nhiều trường đại học và một số các cơ sở giáo dục đại học khác. Ngoài ra, đại học đào tạo nhiều lĩnh vực, trong mỗi lĩnh vực có thể có nhiều ngành khác nhau. Người đứng đầu đại học là giám đốc, khác với trường đại học người đứng đầu là hiệu trưởng.
